江戸中期

15万石に加増され最盛期を迎える

村上城下の発展に尽力した直竒は、寛永16年（1639年）に家督を息子の直次に譲り隠居する。しかし、不幸なことに、直次は25歳の若さで亡くなり、急遽その跡を継いだ直次の息子、千助（のち直定）までが７歳という短命で亡くなってしまった。ここに村上の堀家は絶家となってしまい、以後、1662～1644年の幕府領、1644～1649年の本田忠義10万石と短期政権が続き、慶安２年（1649年）に姫路から移封されてきた松平直矩（まつだいら・なおのり）のもと、ようやく藩主が安定する。

松平のブランドネームが効いたのか、このとき、三条町（現三条市）周辺の「蒲原４万石」が加増され、村上藩は15万石の大藩となる。増えた家来の屋敷地をまかなうために城下町は拡大、町屋の増加も著しく、当時の村上町の人口は１万８千人に達していたという。これは平成の市街地人口に匹敵するばかりか、当時の新潟町の人口（約13400人：1680年）すら凌駕する（※1）。紛れもなく当時の村上は、越後有数の大都市であった。

天守の新造と相次ぐ城普請

広大な藩領に支えられた財力を背景に、松平氏は寛文３年（1663年）より、村上城のさらなる改築にとりかかる。この時の工事は、地ならしからやり直すほど大規模なもので、堀氏の建てた門や櫓の多くが新築されたと思われる（※2）。中でも、天守の新造は工事の目玉であり、その外観は唐破風を備えた華美なものに一新されたという。また、城郭の修築にとどまらず、この時期には山麓居館の拡大や、居館北側の岩手郭への新御殿造営など、派手な普請が相次いだ。

しかし、このバブリーな建築ラッシュに沸いたのもつかの間、寛文７年（1667年）、本丸の他の櫓も道連れに、天守は落雷で焼失してしまう。流石にこれに懲りたのか、以後、天守櫓が再建されることはなかった。

５万石に減封後、内藤氏のもとで安定期

松平氏の後、村上城には同じく姫路より榊原政倫が15万石で入り、政倫、勝乗の２代にわたって宝永元年（1704年）まで在城する。しかし、その後に入った本田忠孝が後継を定める間もなく早世したため、村上藩の石高は従来の1/3に過ぎない５万石まで一気に減封される。

多数の家来に暇が出された結果、城下町は空き地だらけになり、人口も１万人を割るところまで激減した（※）。また、その後に入った松平輝貞（1704～1717）、間部詮房（1717-19）も短期政権だった上に、経済規模はそれぞれ7.2万石と5万石。さらにこの間は、洪水や落雷などの天災、百姓一揆などの社会不安が相次いだ時期であった。外郭土塁上の塀や櫓は逐次失われ、火災で焼けた門の再建なども断念されるようになっていった。10万石→15万石と拡張を続けてきた城を、５万石の経済規模では維持しきれなかったのである。

そんな状況がようやく安定したのは、享保５年（1720年）の内藤家の入封以降のことである。内藤氏は三河以来の譜代の家で、石高こそ５万石であったが、幕府の信頼は厚く、大阪城代（弌信）、京都所司代（信敦・信親）、老中（信親）など要職に就くことも度々であった。また、小藩の財政を潤すべく、堆朱工芸や鮭の増産が図られ、以後の地場産業の基礎となっていった。

城郭の保全においては、焼失した建物などの再建はままならなかったものの、土塁の草刈りや桝形の清掃、「堀底さらい」などが定期的に行われていたことが記録上から確認できる。傷んだ建物の修築なども、割とこまめに行われていたようだ。